云南省市县（区）农业部门了解灾情和动物疫病防控情况，指导灾区做好疫情监测、死亡动物尸体清理和无害化处理、环境消毒等灾后防疫工作，截至目前，云南省、昭通市和鲁甸、巧家、昭阳、永善四县区农业(畜牧)部门共出动车辆330车次1986人次参与地震灾区灾情排查、无害化处理、消毒、检疫和免疫工作。
鲁甸“8.03”地震后，云南省市县(区)农业部门迅速采取行动，了解灾情和动物疫病防控情况，指导灾区做好疫情监测、死亡动物尸体清理和无害化处理、环境消毒等灾后防疫工作，防止重大动物疫情发生与流行。
云南省农业厅紧急下拨动物防疫经费60万元，紧急调运了30吨消毒药品、500台喷雾器和25台电动喷雾器、500套标志防护服等救灾物资，并安排动物疫控中心和畜科所的8名专家团分两组一直在昭通救灾第一线指导动物防疫工作。昭通市市县区农业部门也组成一线救灾工作组赶赴灾区，分别在受灾的48个乡镇成立了2-3人组成的乡镇消毒灭源和无害化处理工作队，灾区各村相应成立了3-5人的小分队。8月16日又抽调55人赴灾区再次组织对重灾乡镇、村进行拉网式排查、无害化处理和对厩舍和周围环境的反复消毒灭源工作。
昭通市重大动物疫病防治指挥部先后下发了《昭通市重大动物疫病防治指挥部办公室关于认真做好鲁甸8.03地震抗震救灾期间动物疫病防控工作的紧急通知》等文件，组织制定了《昭通市鲁甸8.03地震抗震救灾期间动物疫病防控工作实施方案》，编撰印发《地震死亡畜禽无害化处理规范》、《如何鉴别健康猪肉与病死猪肉》等技术知识。
截至目前，云南省、昭通市和鲁甸、巧家、昭阳、永善四县区农业(畜牧)部门共出动车辆330车次1986人次参与地震灾区灾情排查、无害化处理、消毒、检疫和免疫工作。对灾区倒塌厩舍及其环境、死亡畜禽无害化处理场所进行彻底消毒;对受灾区房屋厩舍未倒塌的养殖场户畜禽饲养场所、动物及其产品交易市场、屠宰场、畜产品加工场地进行全面消毒。
